O Metronidazole é convertido em produtos de redução que interagem com o ADN para causar a destruição da estrutura helicoidal do ADN e da cadeia que conduz a uma inibição da síntese proteica e à morte celular em organismos sensíveis.

Distúrbios gastrointestinais, por exemplo, náuseas, sabor metálico desagradável, vómitos, diarreia ou obstipação. Língua furada, glossite e estomatite devido ao crescimento excessivo de Cândida. Raramente, colite associada a antibióticos. Fraqueza, tonturas, ataxia, dor de cabeça, sonolência, insónia, mudanças de humor ou estado mental. Entorpecimento ou formigueiro nas extremidades, convulsões epileptiformas (doses elevadas ou tratamento prolongado). Leucopenia transitória e trombocitopenia. Reações de hipersensibilidade. Desconforto uretra e escurecer de urina. Valores da enzima hepática elevada, hepatite colestática, icterícia. Tromboflebite (IV).